Bueno... caro caro...
Lo de toyota te lo decía, no porque sean mejores (que en algunos SAT dejan mucho que desear) sino porque la arreglen con recambios originales, cosa que en mucho sitios no hacen y en este caso, como es una caja de cambios y encima es un problema bastante habitual, es posible que toyota sacase las piezas de recambio con los posible errores solucionados, como ha pasado en otras cosas que vienen mal de serie y en el recambio estan mejoradas.
Es dinero, pero tu piensa ya simplemente lo que estan cobrando por poner un embrague y tirarte la caja abajo (lo de menos es el disco embrague). Abrir una caja no es facil y no en todos los sitios lo hacen, porque lleva mucho tiempo y aveces no se soluciona y hay que volver a quitarla, asi que imaginate si cobran poco y luego tiene que hacer el trabajo 2 o 3 veces porque queda mal... En fin, yo el precio no lo veo desorbitado. Esta claro que puedes encontrar una en desguace, pero si en este sitio "te garantizan" que va a quedar como nueva, hay que aguantarse y pagar.
Ademas dices que son muy profesionales por lo que parece, entonces prefiría pagar (en este caso) esa cantidad y que quede bien a pagar la mitad en otro taller que la haga "a la aventura" y no quede bien. Tu eres el que paga y tiene que pensarlo. Si encontrases una caja barata de desguace y sabiendo que esta bien, tambien sería buena opción.