Yo la verdad que veo mucho más complicado meter otra Ecu a montar la original aunque tenga inmovilizador.
Si esta claro que ya depende el enfoque del proyecto,si el motor esta modificado no quedará otra que tener una ecu que permita ajustes.
complicado lo que "tiene" es que hay que mapear pero un tunner en un día de banco y pruebas en carretera te lo deja fino, lo demás es hacerle un cableado de motor nuevo que encima hasta lo haces más simplificado que uno OEM que simplificar uno OEM para temas de swap y tal tiene mucha cosa y más como no tengas diagramas